Diversidade alélica de dois membros da família das OMP de Helicobacter pylori, genes jhp870 e jhp649
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Data
2006
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Editora
Edições Universitárias Lusófonas
Resumo
Helicobacter pylori coloniza o estômago humano e está associada a várias gastropatologias.
Este trabalho teve como objectivo o estudo de dois membros da família das OMP de H. pylori, o gene jhp870, possível marcador da úlcera péptica, e o seu homólogo jhp649. A prevalência destes genes,
a variabilidade no número de cópias, a sua localização genómica e o estudo dos polimorfismos, ao nível
da sequência de bases e respectivas proteínas, foram avaliados numa amostra de estirpes clínicas
de H. pylori, isoladas de doentes de diferentes regiões geográficas, apresentando diversas gastropatologias.
No geral, ambos os genes apresentam uma elevada similaridade quer ao nível de nucleótidos quer
de aminoácidos, observando-se, no entanto, uma região média muito polimórfica. Nesta, foram identificadas seis variantes alélicas (alelo AI a AVI), com diferentes prevalências nos dois genes.
O alelo AI é exclusivo e predominante do gene jhp870, e o AII predominante do gene jhp649.
A observação da constância destes alelos em todas as estirpes, independentemente da sua origem geográfica, patologia, tipo de população, sugere a sua antiguidade, e evidencia a sua conservação
ao longo da evolução. Mais, ao existir esta conservação numa região polimórfica, implica que estes alelos podem ter influência na função da proteína.
Helicobacter pylori colonizes the human stomach and is associated with various gastropathologies. The present study aims to research two members of the H. pylori OMP family, jhp870 gene, an ulcer marker candidate, and his homologue jhp649. The prevalence of these genes, number of copies, genomic localization and sequence polymorphisms, were evaluated in a panel of clinical H. pylori strains isolated of patients from different geographic regions, presenting different gastropathologies. Both genes displayed a high level of nucleotide and amino acid similarity. However, an extremely polymorphic region was observed, corresponding to the middle region of each gene, which shows six allelic variants (allele AI to AVI) with different prevalence in the two genes. Allele AI is exclusive and predominant of jhp870 gene, and AII is predominant of jhp649 gene. The maintenance of the alleles in all strains, independently of the geographical origin, pathology and population, suggests their antiquity, and shows conservation up along the evolution. Furthermore, the existence of an allelic conservation in a polymorphic region, implicates that these alleles can influence the protein function.
Helicobacter pylori colonizes the human stomach and is associated with various gastropathologies. The present study aims to research two members of the H. pylori OMP family, jhp870 gene, an ulcer marker candidate, and his homologue jhp649. The prevalence of these genes, number of copies, genomic localization and sequence polymorphisms, were evaluated in a panel of clinical H. pylori strains isolated of patients from different geographic regions, presenting different gastropathologies. Both genes displayed a high level of nucleotide and amino acid similarity. However, an extremely polymorphic region was observed, corresponding to the middle region of each gene, which shows six allelic variants (allele AI to AVI) with different prevalence in the two genes. Allele AI is exclusive and predominant of jhp870 gene, and AII is predominant of jhp649 gene. The maintenance of the alleles in all strains, independently of the geographical origin, pathology and population, suggests their antiquity, and shows conservation up along the evolution. Furthermore, the existence of an allelic conservation in a polymorphic region, implicates that these alleles can influence the protein function.
Descrição
Revista Lusófona de Ciências e Tecnologias da Saúde
Palavras-chave
MEDICINA, DOENÇAS DO SISTEMA DIGESTIVO, BACTÉRIAS, GENÉTICA, MEDICINE, DIGESTIVE SYSTEM DISEASES, BACTERIA, GENETICS